2018–Now
Pèptids Antimicrobians
Proteïnes recombinants multidomini que combinen pèptids de defensa per superar la resistència als antibiòtics.
Protein EngineeringAMR
Dissenyant proteïnes
i vectors virals.
Combatent la resistència antimicrobiana i avançant la teràpia gènica mitjançant disseny computacional i validació experimental.
Desplaçar
01. Treballs Seleccionats
2019–2022
Enginyeria de Proteïnes
Cossos d'inclusió funcionals i bastides de cremalleres de leucina com a nanomaterials bioactius.
Inclusion BodiesNanomaterials
2022–Now
ML en Biologia
Aplicant aprenentatge profund al descobriment de pèptids antimicrobians i optimització de càpsides.
Machine LearningProtein Design
2021–Now
Enginyeria de Càpsides AAV
Evolució dirigida de càpsides AAV per a millor direccionament tissular i transducció de cèl·lules CAR-T.
AAVDirected Evolution
2018–2023
Cossos d'Inclusió Funcionals
Enginyeria d'agregats proteics com a nanopartícules bioactives per a aplicacions farmacèutiques.
BiomaterialsNanoparticles
2023–Now
Vectors de Teràpia Gènica
Avaluació preclínica de vectors AAV usant perfusió hepàtica ex situ i models murins humanitzats.
Gene TherapyRare Disease
02. La Història
Explorant espais que cap laboratori pot cobrir.
La meva formació abasta des d'un grau en Biotecnologia a Barcelona fins a un Màster en Enginyeria Biomèdica a UC Irvine. Durant el meu doctorat, vaig dedicar quatre anys al disseny de proteïnes antimicrobianes multidomini, cosa que va resultar en dues patents.
Al Children's Medical Research Institute (CMRI) a Sydney, vaig construir i liderar una plataforma computacional de descobriment de pèptids. Vaig combinar anàlisi de seqüències a gran escala, models de llenguatge de proteïnes i pipelines accelerats per GPU per dissenyar i validar experimentalment més de 100 candidats de pèptids antimicrobians.
També vaig contribuir significativament a l'enginyeria de càpsides AAV i evolució dirigida per a teràpies gèniques. No faig servir la computació com a reemplaçament del laboratori, sinó per explorar espais i seqüències que cap laboratori pot cobrir per si sol.
Competències Clau
- Models de Llenguatge de Proteïnes
- Enginyeria de Càpsides AAV
- Python i Ciència de Dades
- Descobriment Antimicrobià
- Pipelines Accelerats per GPU
- Biologia Molecular
2021 – 2026
Investigador
Children's Medical Research Institute, SydneyVaig construir i liderar una plataforma computacional de descobriment de pèptids combinant anàlisi de seqüències a gran escala, models de llenguatge de proteïnes i pipelines GPU. Vaig dissenyar i validar experimentalment més de 100 candidats de pèptids antimicrobians.
2016 – 2020
Investigador Predoctoral
UAB & IRTA, BarcelonaVaig iniciar una nova línia de recerca de pèptids antimicrobians des de zero; vaig dissenyar proteïnes recombinants d'ampli espectre, vaig registrar 2 patents i vaig publicar 8 articles.
2015 – 2016
Investigador de Màster
University of California, IrvineSeguiment de la dinàmica de receptors d'estrogen en cèl·lules vives mitjançant microscòpia de fluorescència de molècula única i anàlisi quantitativa d'imatges.
03. Escrits
2020
Microbial Cell Factories
Una nova generació de proteïnes antimicrobianes
Vam fusionar múltiples dominis antimicrobians en polipèptids recombinants que superen les seves parts individuals contra bacteris resistents.
Microbial Cell Factories
Cremalleres de leucina per a cossos d'inclusió funcionals
Les cremalleres de leucina dirigeixen l'agregació controlada de proteïnes en nanopartícules bioactives — obrint una nova classe de biomaterials per a lliurament de fàrmacs.
Explorant espais que cap laboratori pot cobrir.
Unint computació i biologia. 20+ publicacions, 300+ cites i 2 patents en descobriment de fàrmacs antimicrobians i enginyeria de proteïnes.
ramon.rocap@gmail.com