Perfil
Enginyer biomèdic combinant disseny computacional de proteïnes, validació experimental i models translacionals en descobriment antimicrobià i teràpia gènica.
Publicacions
20+
Citacions
300+
Patents
2
Països
3
Posició actual
Children's Medical Research Institute, Sydney
Vam construir una plataforma computacional per al descobriment de pèptids antimicrobians —de prediccions amb models de llenguatge de proteïnes a la validació preclínica en models de ratolí— i vam estendre el mateix enfocament a l'enginyeria de càpsides d'AAV per a teràpia gènica.
Models de llenguatge de proteïnes
Enginyeria de càpsides AAV
Python i ciència de dades
Descobriment antimicrobià
Recerca seleccionada
Enginyeria de proteïnes des del disseny computacional fins a la validació preclínica, entre el descobriment antimicrobià i la teràpia gènica.
01
2024
Molecular Therapy
Vaig evolucionar càpsides AAV que milloraven la generació dirigida de CAR-T i reduïen la dosi vectorial necessària en l'edició de limfòcits T primaris.
02
2024
Nature Communications
Vaig fer servir perfusió de fetge humà complet per comparar vectors AAV en un model preclínic amb rellevància clínica.
03
2023
Molecular Therapy Methods & Clinical Development
Vaig caracteritzar el model de ratolí humanitzat FRG i vaig desenvolupar una variant d'AAV-LK03 amb millor biodistribució lobular hepàtica.
2022 / Microbial Cell Factories
Vaig revisar com els pèptids recombinants de defensa de l'hoste es poden dissenyar i produir per portar-los cap a teràpies antimicrobianes.
Veure article2020 / Microbial Cell Factories
Vaig construir proteïnes recombinants multidomini amb activitat antimicrobiana d'ampli espectre en format soluble i en nanoclúster.
Veure article2021 / International Journal of Molecular Sciences
Vaig seleccionar confòrmers proteics de més qualitat a partir de mescles recombinants de cossos d'inclusió per millorar activitat i estabilitat.
Veure articleFocus de recerca
ESM-2, ProtTrans, anàlisi de seqüències amb pLM
Evolució dirigida, llibreries de càpsides, enginyeria de tropisme
PyTorch, scikit-learn, pandas, pipelines de dades
Disseny de pèptids, assajos MIC, eficàcia in vivo
Models de ratolí, farmacocinètica, toxicologia
Clonatge, expressió proteica, assajos funcionals
Experiència
Tres països, tres laboratoris i un focus constant: convertir idees a nivell de seqüència en evidència experimental.
Em vaig formar en Biotecnologia a la UAB, vaig fer un màster d'Enginyeria Biomèdica a UC Irvine i vaig tornar a la UAB per a un doctorat en què vam dissenyar proteïnes antimicrobianes de cap a peus —del disseny de seqüència a la producció recombinant i els assajos funcionals—. D'aquella etapa van sortir dues patents i quatre articles com a primer autor.
Al CMRI de Sydney vam muntar una plataforma per analitzar milions de seqüències i descobrir centenars —a vegades milers— de nous pèptids antimicrobians. Amb models de llenguatge de proteïnes i els avenços recents en IA, vam provar aquestes prediccions tant al laboratori com en models preclínics. En paral·lel, vam aplicar IA generativa a l'enginyeria de proteïnes per dissenyar càpsides d'AAV per a teràpia gènica.
2021 - 2026
Children's Medical Research Institute, Sydney
Vam construir una plataforma computacional per al descobriment de pèptids antimicrobians —de prediccions amb models de llenguatge de proteïnes a la validació preclínica en models de ratolí— i vam estendre el mateix enfocament a l'enginyeria de càpsides d'AAV per a teràpia gènica.
2016 - 2020
UAB i IRTA, Barcelona
Vam dissenyar proteïnes antimicrobianes des de zero —clonatge, producció recombinant, assajos funcionals—. Dues patents i quatre articles com a primer autor, vuit en total.
2015 - 2016
University of California, Irvine
Vam rastrejar la dinàmica del receptor d'estrògens en cèl·lules vives amb microscòpia de fluorescència de molècula única i anàlisi quantitativa d'imatge.
Parlar d'una oportunitat
Obert a rols i col·laboracions on el disseny computacional, la biologia molecular i la validació translacional hagin de treballar junts.
